Den 16. februar 2016 beordrede en amerikansk føderal dommer Apple til at hjælpe FBI med at hacke ind i iPhone ejet af Syed Farook, en af ​​skytterne i december 2015 angreb i San Bernardino.

FBI bad Apple om at skabe en version af iOS, der både ville deaktivere adgangskodesikkerhedsfunktioner og tillade adgangskoder at blive indtastet elektronisk, hvilket gør det muligt for det at brute force adgangskoden på enheden.

Apple meddelte, at de ville modsætte sig ordren i et åbent brev skrevet af Tim Cook, som sagde, at FBI's anmodning ville skabe en 'farlig præcedens' med alvorlige konsekvenser for fremtiden for smartphone-kryptering. Apple sagde, at den software, FBI bad om, kunne tjene som en 'hovednøgle', der kunne bruges til at få information fra enhver iPhone eller iPad - inklusive dens seneste enheder - mens FBI hævdede, at de kun ønskede adgang til en enkelt iPhone.

Apples tvist med FBI sluttede den 28. marts 2016, efter at regeringen fandt en alternativ måde at få adgang til data på iPhone ved hjælp af det israelske firma Cellebrite og trak sagen tilbage.